Pembudayaan Agama merupakan sebuah proses dan usaha dalam menjalankan budaya madrasah dengan sikap, pengetahuan dan keterampilan, tradisi yang ada dalam madrasah, yang diupayakan mampu mendasari pembentukan karakter siswa. Pembudayaan agama di madrasah ini dijadikan sebagai ruhnya madrasah untuk meningkatkan spiritualitas madrasah ini.
- Pembudayaan agama melalui pembiasaan Pembiasaan budaya madrasah yang diterapkan merupakan salah satu upaya untuk menanamkan nilai-nilai karakter yang melakat pada diri siswa. Bentuk-bentuk pembiasaan yang dilaksanakan dilingkungan madrasah ini dilakukan melalui pengintergrasian kedalam kegiatan harian, mingguan dan tahunan.
- Pembudayaan agama melalui artefak Bentuk pembiasaan budaya yang lain selain dengan kegiatan-kegiatan, di madrasah ini juga terdapat artefak-artefak yang diletakkan di lingkungan madrasah yang strategis dan mudah dibaca oleh setiap siswa dan tamu yang berkunjung sebagai motivasi dan pengingat, seperti jargon-jargon penyemangat, doa-doa harian, asmaul husna serta tata tertib berbusana syar`i.